Selain ruang perkuliahan, perpustakaan, laboratorium komputer, dan asrama, STK St. Yakobus Merauke menyediakan berbagai prasarana penunjang lain untuk mendukung kelancaran proses pembelajaran dan kegiatan kemahasiswaan.
Laboratorium Liturgi & Pastoral
Untuk praktik liturgi dan pastoral mahasiswa, dilengkapi mimbar, altar, peralatan dan pakaian liturgi/misa, serta buku dan sarana pastoral penunjang perkuliahan.
Lapangan Olahraga
Lapangan futsal dan voli, umumnya digunakan sore hari atau Sabtu di luar jam perkuliahan, dapat dimanfaatkan seluruh sivitas akademika.
Free WiFi / Hotspot Area
Akses internet gratis bagi seluruh sivitas akademika untuk mendukung iklim pembelajaran yang variatif, kontekstual, dan efisien.
Aula Serba Guna
Menjadi prioritas pembangunan kampus untuk terus ditingkatkan kualitas dan kapasitasnya, menunjang kegiatan akademik dan kemahasiswaan.
Lahan Wirausaha
Memanfaatkan lahan kampus untuk kebun sayur organik, kolam ikan, dan peternakan ayam pedaging, menunjang kurikulum kewirausahaan mahasiswa.
Ruang Foto Copy
Menyediakan layanan fotokopi dan penggandaan dokumen bagi mahasiswa dan sivitas akademika di lingkungan kampus.
Bus Kampus
Kendaraan operasional untuk menunjang kegiatan akademik, kemahasiswaan, dan pengabdian kepada masyarakat.