Makna Logo STK St. Yakobus Merauke
Lambang STK St. Yakobus Merauke berbentuk perisai bersisi lima dan terdapat lekukan kecil pada setiap sisi, dengan sebuah tifa dan tujuh panah yang berwarna merah, sebuah buku dalam keadaan terbuka yang bertuliskan lambang Alfa dan Omega dan tulisan Sekolah Tinggi Katolik Santo Yakobus Merauke berwarna kuning emas di dalamnya.
Sudut lima melambangkan Pancasila.
Tifa dengan tujuh panah adalah simbol tujuh karunia Roh Kudus, tujuh suku besar di Papua Selatan.
Kitab Suci/buku dalam keadaan terbuka merupakan sumber inspirasi dan bermakna bahwa ilmu pengetahuan akan selalu berkembang.
Alfa dan Omega: Tuhan adalah awal dan akhir dari kehidupan. Sebagai sumber dan tujuan kehidupan manusia.
Mars STK St. Yakobus Merauke
Civitas akademika Sekolah Tinggi Katolik Merauke
Mengayun langkah dengan pasti
Wujudkan tujuan mulia pendidikan bangsa
Di bawah Panji Pancasila
Junjung martabat luhur kawula nusantara
Baktikan cipta rasa dan karsamu
Untuk anim ha Indonesia tercinta
Ref: Putra-putri pertiwi wujud niat
hatimu
Gapailah citamu bersama STK
Dekatkan Hatimu Kepada Tuhan
Berbaktilah Bagi Negri Persada
Warnai Baktimu dengan kasih humanis
Jalin relasi antar civitas akademika
Dalam ilmu dan etika disiplin diri kau jaga
Tujuh suku besar pantai Arafura
Selalu mengharapkan jasamu
Dharma baktikanlah dirimu
Untuk nusa bangsa dan sesama manusia
Angkatlah martabat yang menderita
Perjuangkan damai cinta kasih
Jadilah sarjana yang berhati jujur, bersih dan nurani yang tulus
Kembali ke Reff>>
Coda: Maju bersatulah bersama STK Merauke jaya
