STK St. Yakobus Merauke memiliki perpustakaan dengan koleksi buku yang memadai untuk menunjang proses perkuliahan, dilengkapi ruang baca yang nyaman bagi mahasiswa yang ingin mencari dan mengolah informasi.
STK telah mengembangkan perpustakaan daring yang dapat diakses publik melalui e-library.stkyakobus.ac.id.
