- Blue Print Pengembangan, Pengelolaan dan Pemanfaatan Sistem Informasi
- Dokumen Formulir (SPMI)
- Dokumen Kebijakan Sistem Penjaminan Mutu Internal (SPMI)
- Dokumen Standar Mutu Perguruan Tinggi Agama Katolik (SPMI)
- Dokumen Standar Mutu Sistem Penjaminan Mutu Internal (SPMI)
- Dokumen Manual Penetapan Standar Sistem Penjaminan Mutu Internal (SPMI)
- Panduan KKN
- Panduan Missio Canonica
- Panduan Penelitian dan PKM
- Panduan Penulisan Skripsi
- Panduan PPL
- Panduan Wisuda
- Pedoman Kerjasama Perguruan Tinggi
- Pedoman Keuangan STK St. Yakobus Merauke Tahun 2019
- Pedoman Laporan Kinerja Dosen (LKD)
- Pedoman Orientasi Mahasiswa Baru
- Pedoman Penerimaan Mahasiswa Baru
- Pedoman Pengelolaan Sarana Prasarana Tahun 2019
- Pedoman Rancangan & Analisis Jabatan STK St. Yakobus Merauke
- Pedoman Standar Operasional Prosedur (SOP)
- Pedoman Tata Pamong STK St. Yakobus 2018-2023
- Panduan Kepegawaian Keuskupan Tahun 2010
- Panduan Kepegawaian YPPK Tahun 2006
- Pedoman Analisis dan Evaluasi Pemutakhiran Kurikulum
- Pedoman Kebebasan Akademik, Kebebasan Mimbar Akademik dan Otonomi Keilmuan
- Panduan Kurikulum Berbasis KKNI Prodi Pendidikan Keagamaan Katolik
- Panduan Kurikulum Merdeka Prodi Pendidikan Keagamaan Katolik
- Pedoman Program Layanan Bimbingan Karir dan Informasi Kerja
- Pedoman Sistem Monev dan Rekam Jejak Kinerja SDM
- Pedoman Sistem Pengelolaan Sumberdaya Manusia
- Pedoman Pengembangan Kurikulum
- Pedoman Sistem Pengembangan Suasana Akademik
- Pedoman Sistem Informasi Pengelolaan Proses Pembelajaran
- Pedoman Sistem Informasi Pengelolaan Administrasi Umum
- Pedoman Sistem Informasi Pengelolaan Prasarana dan Sarana