- Dokumen Kebijakan Sistem Penjaminan Mutu Internal (SPMI)
- Manual Penetapan Standar Sistem Penjaminan Mutu Internal (SPMI)
- Dokumen Standar Mutu Sistem Penjaminan Mutu Internal (SPMI)
- Dokumen Standar Mutu Perguruan Tinggi Agama Katolik (SPMI)
- Dokumen Formulir (SPMI)
- Pedoman Tata Pamong STK St. Yakobus 2018-2023
- Pedoman Rancangan & Analisis Jabatan STK St. Yakobus Merauke
- Pedoman Standar Operasional Prosedur (SOP)
- Pedoman Keuangan STK St. Yakobus Merauke Tahun 2019
- Pedoman Pengelolaan Sarana Prasarana Tahun 2019
- Pedoman Kerjasama Perguruan Tinggi
- Pedoman Penerimaan Mahasiswa Baru
- Pedoman Orientasi Mahasiswa Baru
- Pedoman Laporan Kinerja Dosen (LKD)
- Panduan Penelitian dan PKM
- Panduan Kepegawaian Keuskupan Tahun 2010
- Pedoman Program Layanan Bimbingan Karir dan Informasi Kerja
- Pedoman Sistem Monev dan Rekam Jejak Kinerja SDM
- Pedoman Sistem Pengelolaan Sumberdaya Manusia
- Panduan Kurikulum Berbasis KKNI & SN-DIKTI
- Pedoman Pengembangan Kurikulum
- Pedoman Analisis dan Evaluasi Pemutakhiran Kurikulum
- Pedoman Kebebasan Akademik, Kebebasan Mimbar Akademik dan Otonomi Keilmuan
- Pedoman Sistem Pengembangan Suasana Akademik
- Pedoman Sistem Informasi Pengelolaan Proses Pembelajaran
- Pedoman Sistem Informasi Pengelolaan Administrasi Umum
- Pedoman Sistem Informasi Pengelolaan Prasarana dan Sarana
- Blue Print Pengembangan, Pengelolaan dan Pemanfaatan Sistem Informasi
- Panduan PPL
- Panduan KKN
- Panduan Penulisan Skripsi
- Panduan Missio Canonica
- Panduan Wisuda